Екзом — це частина генома, що містить приблизно 180 тисяч екзонів. Екзон це послідовність ДНК, яка кодує білок, що синтезується. В результаті мутацій порушується робота певних білків або ферментів і у людини може розвинутись те чи інше захворювання.
Екзом становить близько 1% всього генома людини і при цьому містить біля 85% ідентифікованих генетичних варіантів, що викликають захворювання, бо більшість генетичних порушень пов'язані саме з регіонами ДНК, що кодують білки.
Клінічна значущість секвенування екзому
Секвенування екзому — це дослідження, яке дозволяє розшифрувати послідовність генів, що кодують білки та виявити патогенні (небезпечні) генетичні варіанти. Основним у секвенуванні є виявлення мутацій або патогенних генетичних варіантів, наприклад, заміна амінокислот у ланцюзі, випадання декількох ланок з послідовності або їх подвоєння.
За результатами повноекзомного секвенування пробанта рекомендовано проводити генотипування виявлених варіантів у батьків, для визначення цис- чи транс-розташованих варіантів щоб дізнатися успадковані вони чи виникли внаслідок мутації de novo (вперше). В переважній більшості така тактика дозволяє підтвердити діагноз чи вказати в якому напрямку потрібно рухатися далі та чи доцільно розглядати секвенування всього генома.
Кількість пацієнтів, яким встановлюють діагноз після повного аналізу екзому за різними даними складає від 25% до 50%. Проведення аналізів окремих мутацій чи панельне тестування рідше приводить до швидкої постановки діагнозу.
Показання для призначення 3B-EXOME, Proband
Згідно рекомендацій Американського коледжу медичної генетики та геноміки (American College of Medical Genetics and Genomics) секвенування екзому призначають:
- пацієнтам з підозрою на рідкісні моногенні захворювання для уточнення діагнозу;
- пацієнтам з вадами розвитку, когнітивними та інтелектуальними вадами як тест першої лінії;
- якщо лікар підозрює генетичне захворювання, але хворобу неможливо розпізнати лише за фенотипом пацієнта;
- якщо хворобу не діагностовано після численних панельних ДНК тестів;
- якщо необхідні дані для встановлення діагнозу не охоплюються однією чи навіть кількома панелями генетичних тестів;
- у разі необхідності виявлення статусу носійства мутації перед запланованою вагітністю.
Матеріал для дослідження
Букальний епітелій в спеціальному контейнері або кров ЕДТА на спеціальному фільтрі.
Правила підготовки пацієнта до секвенування екзому
- Кров ЕДТА
Забір біологічного матеріалу проводиться незалежно від прийому їжі чи лікарських препаратів. Важливою умовою забезпечення достовірності результатів є відсутність переливань крові чи її компонентів пацієнту протягом останніх 2х місяців.
- Букальний епітелій
За пів години до забору біологічного матеріалу не їсти, не пити, не жувати жувальну гумку, не палити.
